ELFT HÍRADÓ

[ortvay AT achilles.elte.hu (Ortvay kollokvium)]

ELTE Fizika Intezet


                             ORTVAY KOLLOKVIUM

                   2006. november 30. , csutortok, 15 orakor
  Az ELTE Pazmany Peter s. 1/A alatti epuleteben a foldszinti 0.83 eloadoban

                           Osvath Szabolcs-Fidy Judit
                          (SOTE Biofizikai Intezet): 
                "Egy feherje kalandos utazasa energia-tajakon" 

Kivonatos ismertetes:

Az elmult evtized szekvenalasi munkainak eredmenyekeppen mara mar az 
embernek, 
valamint tobb noveny es allatfajnak a teljes genetikai allomanya ismert. A 
genetikai kod azonban a polimer szerkezetu DNS, RNS es feherje molekulaknak 
csak a szekvenciajat (monomer-sorrendjet) tarja fel elottunk. A biologiailag 
aktiv terszerkezet kialakulasat (folding) es a funkciohoz szukseges 
konformacio-valtozasokat (konformacios dinamika) szinten a szekvencia 
hatarozza 
meg, azonban ezek az osszefuggesek ma meg feltaratlanok. Mivel azonban ezek 
az 
ismeretek vezetnek el a nagy mennyisegu szekvencia-informacio ipari es orvosi 
hasznositasahoz, intenziv kutatasok iranyulnak a dinamikai es a folding 
jelensegek hattereben allo kolcsonhatasok melyebb megertesere. 
Munkacsoportunkban mindket iranyban vegzunk vizsgalatokat. 

Az eloadasban a glikolizis egyik fontos enzime, a ket domenbol allo 
foszfoglicerat kinaz (PGK) enzim terszerkezetet meghatarozo folding 
folyamatrol 
mutatunk be kiserleti es elmeleti eredmenyeket. A kiserletekhez elkeszitettuk 
az elesztoben elofordulo enzim olyan mutansait, amelyek lehetove tettek, hogy 
fluoreszcencia meressel kovessuk az egyes izolalt domenek, a feherje reszet 
kepezo domenek es a teljes feherje folding folyamatanak kinetikajat a ms 
tartomanytol a teljes folyamat vegeig (15 perc). Erdekes eredmeny volt, hogy 
a 
domenek kozotti kolcsonhatas befolyasolja az egyes domenek folding 
kinetikajat, 
azonban a ket domenben egymastol eltero modon. A kinetika elmeleti 
ertelmezesere energia-felszin modellt hasznaltunk. Annak ellenere, hogy a 
folding es misfolding folyamatok magyarazatara elterjedten hasznalt ez a 
kozelites, igen keves olyan modell letezik, amelyik konkret feherjenek a 
gombolyodasat kvantitativ modon leirna. Az altalunk kidolgozott modell az 
eleszto PGK enzim foldingjanak kvantitativ termodinamikai leirasat adja meg a 
milliszekundumoktol a feherje teljes felgombolyodasaig. Eszerint a folding 
korai szakasza egy jol meghatarozott hierarchikus strukturaval rendelkezo 
energiafelszinen zajlik, ami nem-exponencialis gombolyodasi kinetikat 
eredmenyez a reakcionak ebben a korai szakaszaban. Az energia-felszin 
alacsonyabb energiaju reszet egy nagy melyedes dominalja, ami egy olvadt 
gomboc 
intermedier allapot felhalmozodasat eredmenyezi. Ebbol az intermedier 
allapotbol egy aktivacios gaton keresztul jut el a feherje az energiafelszin 
legmelyebb godrebe, ami a nativ szerkezet felhalmozodasat jelenti. A modell a 
fentebb vazolt energiafelszint kvantitativan jellemzi, es a kiserleteinkkel a 
meresi hiba hataran belul egyezest mutat. 

Minden erdeklodot szivesen latunk! Az eloadas elott negyed oraval 
az eloadoban teat szolgalunk fel.
Az eloadas-sorozatrol az interneten az "ortvay-koll.elte.hu" cimen 
talalhato informacio.