ELFT HÍRADÓ

[Ortvay kollokvium <ortvay AT achilles.elte.hu>]

ELTE Fizika Intezet


                             ORTVAY KOLLOKVIUM

                    2006. februar 23. , csutortok, 15 orakor
  Az ELTE Pazmany Peter s. 1/A alatti epuleteben a foldszinti 0.83 eloadoban

                                  Simon Istvan 
                       (MTA SzBK Enzimologiai Intezet ): 
                      "Feherjek statisztikus biofizikaja" 

Kivonatos ismertetes:

 Az elo szervezetekben az energia es informacio tarolas es bizonyos 
mechanikai 
szerkezet stabilizalas kivetelevel szinte minden funkciot feherjek latnak el. 
A 
feherjek egy vagy tobb, elagazas mentes polipeptid lancbol epulnek fel. A 
polipeptidek huszfele aminosav-gyokbol epulnek fel. Ezek lancon beluli 
sorrendje, a szekvencia, egyertelmuen meghatarozott egy egyszeru kod alapjan, 
az atoroklodo informaciot hordozo nukleinsavak, DNS illetve RNS, bazis 
sorrendje altal. A bazis sorrend meghatarozasaval ma mar tobb millio feherje 
szekvenciaja valt ismertte. 

Egeszen az ezredforduloig tartotta magat az a nezet, hogy egy adott 
szekvenciaju polipeptid lancot, a szekvencia altal fiziologias korulmenyek 
kozott egyertelmuen meghatarozott terszerkezete teszi mukodokepes feherjeve, 
mert a funkciohoz a polipeptid lanc menten tavoli aminosav-gyokoknek pontosan 
meghatarozott terbeli alakzatokat kell kialakitania. Az utobbi nehany ev 
genom 
kutatasai, melyek tobb mint 200 eloleny bazis sorrendjet illetve aminosav 
szekvenciajat feltartak, jelentosen szinesitettek ezt a kepet. Kiderult, hogy 
a 
genomok altal kodolt feherjek jelentos hanyada reszben vagy egeszben 
rendezetlen szerkezetu. 

A feherjek terszerkezet meghatarozasa altalaban rontgen diffrakcioval, 
ritkabban NMR-rel tortenik. Ezt minden feherjere egyedileg kell elvegezni, 
ezert terszerkezeti adatok az ismert szekvenciaju feherjek csak 1%-ra allnak 
rendelkezesre . Kulonosen nehez a membranokba agyazva mukodo feherjek 
terszerkezet meghatarozasa. Bar ezek az osszes feherje 25-30%-at teszik ki, 
aranyuk a terszerkezeti adatbazisban kb. 1,5%. Ertheto tehat az igeny arra, 
hogy a szekvenciakbol elmeleti uton terszerkezeti informaciokat nyerjunk ki. 
A 
legtobb ilyen becslo eljaras az adatbazisok statisztikus elemzesen alapszik. 
Eloadasomban nehany peldat mutatnek be arra, hogy csoportom milyen 
eredmenyeket 
ert el ezen a teruleten a hatarozott terszerkezetu vizes kozegben oldhato, a 
membranba agyazodo, illetve a rendezetlen feherjek vizsgalataban. 

Minden erdeklodot szivesen latunk! Az eloadas elott negyed oraval 
az eloadoban teat szolgalunk fel.
Az eloadas-sorozatrol az interneten az "ortvay-koll.elte.hu" cimen 
talalhato informacio.